پس از فتح تهران، فضلالله نوری بازداشت شد و به حکم ابراهیم زنجانی در ۹ مرداد ۱۲۸۸ در میدان توپخانه حدود یک ساعت و نیم مانده به غروب به دار آویخته شد.