آیت الله سیستانی در پیامی تصمیم کشیش آمریکایی برای آتش زدن قرآن کریم را محکوم کرد و از مقامات آمریکا خواست از چنین عمل زشتی جلوگیری کنند.
در بخشی از این پیام تصریح شده است: «این اقدام زشت هرگز با وظیفه رهبران دینی و معنوی که رسالتشان استوار سازی ارزشهای محبت و همزیستی مسالمت آمیز و استوار بر رعایت حقوق انسانی و احترام متقابل میان همه پیروان ادیان و روشهای گوناگون فکری است همسو نخواهد بود».
آیت الله سیستانی همچنین در این پیام تاکید کرد: «مرجعیت دینی در عین اینکه به شدت یورش به ساحت قرآن کریم را محکوم می کند و بر ضرورت جلوگیری از وقوع آن تاکید دارد از مسلمانان در هر کجا که هستند می خواهد خویشتنداری را پیشه کنند و هرگز با پیروان کلیساهای مسیحی با ناشایستی برخورد نکنند».
