اصلیترین مسائلی که وضعیت تالاب بینالمللی انزلی را به این وضعیت بغرنج رسانده در واقع ورود فاضلابهای صنعتی، خانگی، بیمارستانی، سموم کشاورزی و پسماندها و گیاهان مهاجمی همچون آزولا و سنبل آبی است که علاوه بر آلودگی بستر آن، کاهش میزان آب، حیات تالاب را نیز بهشدت در وضعیت نگرانکننده قرار داد.
روش بایوجیمی یک روش بیولوژیک تسریعیافته است که باعث حذف لجنها از کف تالاب میشود. در این روش از دیاکسیدتیتانیوم، کلرید نقره، پلیساکارید و کود استفاده میشود.