وزارت اطلاعات از آقای صادقی شکایتی را مطرح کرده مبنی بر اینکه علیرغم توضیحات وزیر اطلاعات درباره پرونده ترور دانشمندان هستهای آقای صادقی جلساتی با مظنونان قبلی این پرونده داشته و به آنها قولهای خلاف واقع داده است. همچنین برخی از مطالب طبقهبندی شده درباره ترور دانشمندان هستهای را بیان کرده است.