نجفی انگیزه خود برای قتل را اختلافات خانوادگی عنوان کرد. سرانجام معاینات مقتوله انجام و نتیجه به مرجع قضائی اعلام شد و 13 خردادماه کیفرخواست پرونده «محمدعلی نجفی» صادر شد. سه جلسه دادگاه برای رسیدگی به این پرونده در شعبه 9 دادگاه کیفری یک استان تهران به ریاست قاضی محمدرضا محمدی کشکولی برگزار شد.